Un ancien tueur devient rapidement résistant aux antibiotiques, préviennent les scientifiques
La fièvre typhoïde est peut-être rare dans les pays développés, mais cette ancienne menace, que l’on pense exister depuis des millénaires, est toujours un danger dans notre monde moderne.
Selon de nouvelles recherches, la bactérie responsable de la fièvre typhoïde développe une résistance étendue aux médicaments et remplace rapidement les souches qui ne sont pas résistantes.
Actuellement, les antibiotiques sont le seul moyen de traiter efficacement la typhoïde, qui est causée par la bactérie Salmonella enterica sérotype Typhi (S Typhi). Pourtant, au cours des trois dernières décennies, la résistance de la bactérie aux antibiotiques oraux s’est développée et propagée.
En séquençant les génomes de 3 489 souches de S Typhi contractées de 2014 à 2019 au Népal, au Bangladesh, au Pakistan et en Inde, les chercheurs ont découvert une augmentation récente de Typhi extrêmement résistant aux médicaments (XDR).
XDR Typhi est non seulement insensible aux antibiotiques de première ligne, comme l’ampicilline, le chloramphénicol et le triméthoprime/sulfaméthoxazole, mais il devient également de plus en plus résistant aux nouveaux antibiotiques, comme les fluoroquinolones et les céphalosporines de troisième génération.
Pire encore, ces souches se propagent à l’échelle mondiale à un rythme rapide.
Alors que la plupart des cas de XDR Typhi proviennent d’Asie du Sud, les chercheurs ont identifié près de 200 cas de propagation internationale depuis 1990.
La plupart des souches ont été exportées vers l’Asie du Sud-Est, ainsi que vers l’Afrique orientale et australe, mais des superbactéries typhoïdes ont également été trouvées au Royaume-Uni, aux États-Unis et au Canada.
Les scientifiques mettent en garde contre la typhoïde résistante aux médicaments depuis des années, mais la nouvelle recherche est la plus grande analyse du génome sur la bactérie à ce jour.
En 2016, la première souche typhoïde XDR a été identifiée au Pakistan. En 2019, il était devenu le génotype dominant dans le pays.
Historiquement, la plupart des souches de typhoïde XDR ont été combattues avec des antimicrobiens de troisième génération, comme les quinolones, les céphalosporines et les macrolides.
Mais au début des années 2000, les mutations qui confèrent une résistance aux quinolones représentaient plus de 85 % de tous les cas au Bangladesh, en Inde, au Pakistan, au Népal et à Singapour. Dans le même temps, la résistance aux céphalosporines prenait également le dessus.
Aujourd’hui, il ne reste qu’un seul antibiotique oral : le macrolide, l’azithromycine. Et ce médicament pourrait ne pas fonctionner plus longtemps.
La nouvelle étude a révélé que les mutations qui confèrent une résistance à l’azithromycine se propagent désormais également, « menaçant l’efficacité de tous les antimicrobiens oraux pour le traitement de la typhoïde ». Bien que ces mutations n’aient pas encore été adoptées par XDR S Typhi, si elles le sont, nous avons de sérieux problèmes.
S’ils ne sont pas traités, jusqu’à 20 % des cas de typhoïde peuvent être mortels, et aujourd’hui, il y a 11 millions de cas de typhoïde par an.
Les futures épidémies peuvent être évitées dans une certaine mesure grâce aux vaccins conjugués contre la typhoïde, mais si l’accès à ces vaccins n’est pas étendu à l’échelle mondiale, le monde pourrait bientôt faire face à une autre crise sanitaire.
« L’émergence récente de XDR et de S Typhi résistant à l’azithromycine crée une plus grande urgence pour l’expansion rapide des mesures de prévention, y compris l’utilisation de vaccins conjugués contre la typhoïde dans les pays endémiques de la typhoïde », écrivent les auteurs.
« De telles mesures sont nécessaires dans les pays où la prévalence de la résistance aux antimicrobiens parmi les isolats de S Typhi est actuellement élevée, mais compte tenu de la propension à la propagation internationale, elles ne devraient pas être limitées à ces paramètres. »
L’Asie du Sud pourrait être la principale plaque tournante de la fièvre typhoïde, représentant 70% de tous les cas, mais si COVID-19 nous a appris quelque chose, c’est que les variantes de la maladie dans notre monde moderne et globalisé se propagent facilement.
Pour éviter que cela ne se produise, les experts de la santé affirment que les pays doivent élargir l’accès aux vaccins contre la typhoïde et investir dans de nouvelles recherches sur les antibiotiques. Une étude récente en Inde, par exemple, estime que si les enfants sont vaccinés contre la typhoïde dans les zones urbaines, cela pourrait prévenir jusqu’à 36 % des cas de typhoïde et des décès.
Le Pakistan montre actuellement la voie sur ce front. C’est la première nation au monde à proposer une vaccination systématique contre la typhoïde. L’année dernière, des millions d’enfants ont reçu le vaccin et les experts de la santé affirment que davantage de pays doivent emboîter le pas.
La résistance aux antibiotiques est l’une des principales causes de décès dans le monde, faisant plus de victimes que le VIH/sida ou le paludisme. Lorsqu’ils sont disponibles, les vaccins sont parmi les meilleurs outils dont nous disposons pour prévenir une future catastrophe.
